MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 plasmid pRSC35

Total Repeats: 787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017558	GC	3	6	5	10	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017558	ACG	2	6	53	58	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017558	A	6	6	122	127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017558	GCCCG	2	10	136	145	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_017558	GCG	2	6	186	191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017558	GAACGC	2	12	227	238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017558	GCG	2	6	253	258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017558	AAC	2	6	323	328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017558	ACT	2	6	342	347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017558	GCAA	2	8	387	394	50 %	0 %	25 %	25 %	410683902
11	NC_017558	TGG	2	6	413	418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683902
12	NC_017558	CG	3	6	499	504	0 %	0 %	50 %	50 %	410683902
13	NC_017558	CGA	2	6	585	590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683902
14	NC_017558	GCCG	2	8	641	648	0 %	0 %	50 %	50 %	410683902
15	NC_017558	GAC	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683902
16	NC_017558	AGC	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683902
17	NC_017558	CG	3	6	737	742	0 %	0 %	50 %	50 %	410683902
18	NC_017558	CAT	2	6	780	785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683902
19	NC_017558	CCG	2	6	793	798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683902
20	NC_017558	GC	3	6	821	826	0 %	0 %	50 %	50 %	410683902
21	NC_017558	CGC	2	6	828	833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683902
22	NC_017558	CGT	2	6	843	848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683902
23	NC_017558	TG	3	6	1066	1071	0 %	50 %	50 %	0 %	410683902
24	NC_017558	GC	3	6	1092	1097	0 %	0 %	50 %	50 %	410683902
25	NC_017558	CAC	2	6	1105	1110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683902
26	NC_017558	GC	3	6	1111	1116	0 %	0 %	50 %	50 %	410683902
27	NC_017558	AGC	3	9	1131	1139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683902
28	NC_017558	GCC	2	6	1268	1273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683903
29	NC_017558	GAG	2	6	1292	1297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683903
30	NC_017558	TGC	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683903
31	NC_017558	GAA	2	6	1438	1443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683903
32	NC_017558	GGCC	2	8	1444	1451	0 %	0 %	50 %	50 %	410683903
33	NC_017558	TGG	2	6	1461	1466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683903
34	NC_017558	GTG	2	6	1520	1525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683903
35	NC_017558	GAC	2	6	1535	1540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683903
36	NC_017558	GC	3	6	1561	1566	0 %	0 %	50 %	50 %	410683903
37	NC_017558	TGCGC	2	10	1612	1621	0 %	20 %	40 %	40 %	410683903
38	NC_017558	GTA	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683903
39	NC_017558	CCA	2	6	1911	1916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683903
40	NC_017558	CACG	2	8	1941	1948	25 %	0 %	25 %	50 %	410683903
41	NC_017558	CAA	2	6	1988	1993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683903
42	NC_017558	GGC	2	6	2050	2055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683903
43	NC_017558	TCG	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683903
44	NC_017558	GCG	2	6	2072	2077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683903
45	NC_017558	AAGC	2	8	2078	2085	50 %	0 %	25 %	25 %	410683903
46	NC_017558	TGC	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683903
47	NC_017558	GC	3	6	2151	2156	0 %	0 %	50 %	50 %	410683903
48	NC_017558	CGT	2	6	2176	2181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683903
49	NC_017558	CAGA	2	8	2189	2196	50 %	0 %	25 %	25 %	410683903
50	NC_017558	AAC	2	6	2245	2250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683903
51	NC_017558	CGG	2	6	2255	2260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017558	TTAT	2	8	2291	2298	25 %	75 %	0 %	0 %	410683904
53	NC_017558	A	7	7	2363	2369	100 %	0 %	0 %	0 %	410683904
54	NC_017558	GGCGT	2	10	2415	2424	0 %	20 %	60 %	20 %	410683904
55	NC_017558	GCT	2	6	2432	2437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683904
56	NC_017558	AGCA	2	8	2453	2460	50 %	0 %	25 %	25 %	410683904
57	NC_017558	AAG	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683904
58	NC_017558	CTT	2	6	2510	2515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683904
59	NC_017558	GCC	2	6	2518	2523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683904
60	NC_017558	GT	3	6	2543	2548	0 %	50 %	50 %	0 %	410683904
61	NC_017558	AGC	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683905
62	NC_017558	CTA	2	6	2748	2753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683905
63	NC_017558	GC	3	6	2771	2776	0 %	0 %	50 %	50 %	410683905
64	NC_017558	CCCGG	2	10	2965	2974	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65	NC_017558	TCAA	2	8	3201	3208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017558	CGC	2	6	3253	3258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683906
67	NC_017558	GAC	2	6	3284	3289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
68	NC_017558	GT	3	6	3419	3424	0 %	50 %	50 %	0 %	410683906
69	NC_017558	CGA	2	6	3439	3444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
70	NC_017558	CGAA	2	8	3513	3520	50 %	0 %	25 %	25 %	410683906
71	NC_017558	GCG	2	6	3609	3614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683906
72	NC_017558	AGC	2	6	3714	3719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
73	NC_017558	CG	3	6	3773	3778	0 %	0 %	50 %	50 %	410683906
74	NC_017558	ACG	2	6	3795	3800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
75	NC_017558	CGCCGG	2	12	3810	3821	0 %	0 %	50 %	50 %	410683906
76	NC_017558	CGA	2	6	3868	3873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
77	NC_017558	GAC	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
78	NC_017558	GCCG	2	8	3941	3948	0 %	0 %	50 %	50 %	410683906
79	NC_017558	CG	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	410683906
80	NC_017558	GAA	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683906
81	NC_017558	GGCCG	2	10	4066	4075	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017558	CGA	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683907
83	NC_017558	GCCG	2	8	4368	4375	0 %	0 %	50 %	50 %	410683907
84	NC_017558	GCC	2	6	4430	4435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017558	GGC	2	6	4442	4447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017558	ACA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683908
87	NC_017558	ACG	3	9	4521	4529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683908
88	NC_017558	GCC	2	6	4602	4607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683908
89	NC_017558	GCC	2	6	4673	4678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017558	CGG	2	6	4684	4689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017558	T	6	6	4693	4698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017558	ATA	2	6	4707	4712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017558	AGA	2	6	4713	4718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017558	AAT	2	6	4724	4729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017558	ATT	2	6	4730	4735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017558	TTC	2	6	4740	4745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017558	CCG	2	6	4802	4807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683909
98	NC_017558	CAT	2	6	4821	4826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683909
99	NC_017558	GC	3	6	4900	4905	0 %	0 %	50 %	50 %	410683909
100	NC_017558	CAGC	2	8	4919	4926	25 %	0 %	25 %	50 %	410683909
101	NC_017558	GCA	2	6	5001	5006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
102	NC_017558	CGG	2	6	5015	5020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683909
103	NC_017558	GCA	2	6	5037	5042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
104	NC_017558	GC	3	6	5121	5126	0 %	0 %	50 %	50 %	410683909
105	NC_017558	AGC	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
106	NC_017558	GCC	2	6	5311	5316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683909
107	NC_017558	AGA	2	6	5387	5392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683909
108	NC_017558	CGAG	2	8	5399	5406	25 %	0 %	50 %	25 %	410683909
109	NC_017558	GCAG	2	8	5478	5485	25 %	0 %	50 %	25 %	410683909
110	NC_017558	AGC	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
111	NC_017558	GCAA	2	8	5504	5511	50 %	0 %	25 %	25 %	410683909
112	NC_017558	GCG	2	6	5512	5517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683909
113	NC_017558	AGG	2	6	5519	5524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683909
114	NC_017558	CGA	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
115	NC_017558	CCG	2	6	5588	5593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683909
116	NC_017558	GGCC	2	8	5619	5626	0 %	0 %	50 %	50 %	410683909
117	NC_017558	GCA	3	9	5640	5648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
118	NC_017558	CGC	2	6	5652	5657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683909
119	NC_017558	CGC	2	6	5664	5669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683909
120	NC_017558	GCAA	2	8	5778	5785	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017558	GCC	2	6	5856	5861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017558	CGGGC	2	10	5904	5913	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017558	CCGG	2	8	5942	5949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017558	GCGTTC	2	12	6010	6021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017558	GCC	2	6	6055	6060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017558	CGGGC	2	10	6103	6112	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017558	GC	4	8	6126	6133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017558	CGGT	2	8	6151	6158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017558	GTT	2	6	6245	6250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683910
130	NC_017558	CGC	2	6	6314	6319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683910
131	NC_017558	CTT	2	6	6348	6353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683910
132	NC_017558	CGC	2	6	6422	6427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683910
133	NC_017558	GCT	2	6	6439	6444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683910
134	NC_017558	CGC	2	6	6495	6500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683910
135	NC_017558	CCAC	2	8	6506	6513	25 %	0 %	0 %	75 %	410683910
136	NC_017558	GCC	3	9	6522	6530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683910
137	NC_017558	CCGC	2	8	6561	6568	0 %	0 %	25 %	75 %	410683910
138	NC_017558	GAT	2	6	6573	6578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683910
139	NC_017558	CCA	2	6	6644	6649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683910
140	NC_017558	TTG	2	6	6673	6678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683910
141	NC_017558	TGCC	2	8	6711	6718	0 %	25 %	25 %	50 %	410683910
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269	NC_017558	GGCCG	2	10	12314	12323	0 %	0 %	60 %	40 %	410683918
270	NC_017558	GAC	2	6	12324	12329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683918
271	NC_017558	GC	3	6	12332	12337	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
272	NC_017558	TCG	2	6	12426	12431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683918
273	NC_017558	CAG	2	6	12486	12491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683918
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276	NC_017558	GCCG	2	8	12527	12534	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
277	NC_017558	ACG	2	6	12546	12551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683918
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279	NC_017558	CGG	2	6	12628	12633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683918
280	NC_017558	CCG	2	6	12634	12639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683918
281	NC_017558	TCG	2	6	12700	12705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683918
282	NC_017558	CGA	2	6	12706	12711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683918
283	NC_017558	TCG	2	6	12721	12726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683918
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285	NC_017558	TACCG	2	10	12816	12825	20 %	20 %	20 %	40 %	410683918
286	NC_017558	TCGCGC	2	12	12826	12837	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410683918
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288	NC_017558	TTC	2	6	12901	12906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683918
289	NC_017558	ATC	2	6	12939	12944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683918
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295	NC_017558	TCGC	2	8	13194	13201	0 %	25 %	25 %	50 %	410683918
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303	NC_017558	ACC	2	6	13618	13623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683918
304	NC_017558	GC	3	6	13628	13633	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
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333	NC_017558	G	7	7	14889	14895	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
334	NC_017558	CGA	2	6	14900	14905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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387	NC_017558	CG	3	6	17552	17557	0 %	0 %	50 %	50 %	410683924
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390	NC_017558	GAA	2	6	17695	17700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
391	NC_017558	GCAGC	2	10	17724	17733	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
392	NC_017558	GGC	2	6	17742	17747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
393	NC_017558	GCG	2	6	17828	17833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_017558	A	6	6	17837	17842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_017558	GCG	2	6	17883	17888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683925
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